Τα API μπορούν να χωριστούν στις ακόλουθες κατηγορίες με βάση την κατάσταση πηγής και διπλωμάτων ευρεσιτεχνίας:
Χημικά συνθετικά API: Αυτά τα API λαμβάνονται μέσω χημικών αντιδράσεων ή σύνθεσης και χρησιμοποιούνται συνήθως σε παραδοσιακά φάρμακα μικρού μορίου. Συγκεκριμένα, περιλαμβάνουν αντιβιοτικά (όπως αμοξικιλλίνη, ερυθρομυκίνη), αντιιικά φάρμακα (όπως λαμιβουδίνη, oseltamivir), αναλγητικά (όπως ιβουπροφαίνη, ακεταμινοφαίνη)
API βιοτεχνολογίας: Παράγονται μέσω της βιοτεχνολογίας (όπως η γενετική μηχανική, η ζύμωση κ.λπ.) και χρησιμοποιούνται συνήθως σε βιολογικά προϊόντα και φάρμακα μακρομορίων. Αυτά τα API περιλαμβάνουν μονοκλωνικά αντισώματα (όπως trastuzumab, bevacizumab), ανασυνδυασμένες πρωτεΐνες (όπως ανασυνδυασμένη ανθρώπινη ινσουλίνη, ερυθροποιητίνη), συστατικά εμβολίων (όπως δραστικά συστατικά των εμβολίων ανθρώπινου θηλώματος)
Φυσικά εκχυλισμένα API: δραστικά συστατικά που εξάγονται από φυσικές πηγές, συμπεριλαμβανομένων εκχυλισμάτων ζώων, φυτών, ορυκτών κλπ. Ειδικά παραδείγματα περιλαμβάνουν φυτικά εκχυλίσματα (όπως πακλιταξέλη, ατροπίνη), εκχυλίσματα ζωικών (όπως ηπαρίνη, πρωταμίνη)
Ραδιενεργά API: Περιέχουν ραδιενεργά συστατικά και χρησιμοποιούνται για διάγνωση ή ακτινοθεραπεία ιατρικής απεικόνισης. Για παράδειγμα, διαγνωστικά radiopharmaceuticals όπως Technetium -99 m, κλπ.